Soucieux de pérenniser leur œuvre, les « Gueules Cassées » ont fondé en 2001 leur propre fondation : elle a pour but le soutien aux institutions de toute nature s’intéressant en priorité aux traumatismes de la face et de la tête et à leurs séquelles, mais également aux pathologies d’origine malformative ou tumorale, aux maladies dégénératives affectant le fonctionnement cérébral.
 
Elle est conseillée par un comité scientifique composé de 15 éminents médecins.
 
Elle distribue des bourses d’étude et des aides financières à des équipes de chercheurs, et offre des équipements à des établissements spécialisés dans la traumatologie crânio-maxillo-faciale. La Fondation des Gueules Cassées est d’un apport important pour ce type de recherche auquel peu d’autres mécènes s’intéressent. Elle a, à ce titre, reçu la Médaille d’Or de l’Académie de Médecine 2012.